Cudowny Obraz Matki Boskiej Jackowej..

Natomiast największą atrakcją nawy na lewo od wejścia głównego jest wspominana kaplica Drohojowskich pw. św. Tomasza, z 1578 r. ozdobiona pięknymi portalami i polichromią, która została odnowiona przez Wincentego Pola. Kaplicę ufundował referendarz koronny i starosta przemyski Jan Tomasz Drohojowski. Obecnie znajduje się w niej Przenajświętszy Sakrament, ale w przeszłości służyła także sprawom świeckim, gdyż odbywały się w niej posiedzenia sądów. W 1621 r. na jedno z takich posiedzeń wpadł do kaplicy Piotr Bolestraszycki wraz z Zygmuntem Stadnickim (synem słynnego „Diabła”) i grupą Niemców protestantów i zaatakował szablami oraz z muszkietów swego wroga Piotra Opalińskiego i jego świtę. Po tym krwawym zajściu biskup Wężyk rzucił na przemyskie koscioły interdyk, czyli zakaz odprawiania mszy świętych.

Dostojności przemyskiej katedrze dodaje dźwięk organów, które zostały zakupione w 1928 r. Warto też wspomnieć, że na ścianach i filarach bazyliki umieszczone zostały tablice pamiątkowe poświęcone szczególnie zasłużonym biskupom i kanonikom diecezji przemyskiej, księżom zamordowanym i zmarłym w obozach koncentracyjnych, a także żołnierzom i oficerom poległym w II wojnie światowej.