W okresie powojennym Krzyżtopór stał się własnością Skarbu Państwa. Dopiero w latach 60-tych z inicjatywy Wojewódzkiego Konserwatora Zabytków rozpoczęły się prace badawcze prowadzone przez dwóch znakomitych archeologów: prof. A. Gruszeckiego i J. Kuczyńskiego. W latach 1965 – 67 przeprowadzono pierwsze badania (głównie inwentaryzację i pomiary obiektu