Czarna Hańcza, lewy dopływ Niemna, bierze początek na wysokości 245 m n.p.m. na zboczach wzgórz morenowych leżących na północ od jeziora Hańcza. Płynie przez Pojezierze Wschodniosuwalskie, Pojezierze Sejneńskie i Równinę Augustowską oraz dalej na terytorium Białorusi.