Musiało minąć pięć lat, by następny biskup włocławski Henryk Muszyński otrzymał zgodę na postawienie krzyża na miejscu wrzucenia ks. Jerzego w nurt Wisły. Projekt krzyża – pomnika wykonał Jerzy Kalina z Warszawy jako integralną część ołtarza papieskiego podczas IV pielgrzymki Jana Pawła II do Polski.
Teraz poniżej tamy, na płaskim trawiastym półwyspie wcinającym się w nurt Wisły stoi krzyż. Prowadzą do niego zadbane alejki, obok leży pamiątkowy głaz. Pomnik upamiętniający śmierć ks. Jerzego Popiełuszki stanął tu w 1991 roku, po zakończeniu wizyty Jana Pawła II w Polsce. Stanowi go krzyż papieski, centralny element ołtarza, przy którym Ojciec Święty odprawił mszę na lotnisku Aeroklubu Włocławskiego w Kruszynie podczas IV pielgrzymki do kraju.
Metalowo-szklaną konstrukcję krzyża widać z daleka, nocą jest podświetlona. Pierwotnym zamysłem twórcy pomnika, Jerzego Kaliny, było ustawienie go w nurcie Wisły. Zrezygnowano jednak z tego pomysłu z powodu trudności technicznych oraz w trosce o to, by pomnik był dostępny wszystkim pielgrzymom.
Opiekę nad terenem otaczającym krzyż i samym pomnikiem sprawuje włocławska parafia Matki Boskiej Fatimskiej.